Protein–RNA interactions for Protein: P18850

ATF6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6P18850 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF6P18850 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF6P18850 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF6P18850 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATF6P18850 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATF6P18850 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF6P18850 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF6P18850 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF6P18850 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF6P18850 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF6P18850 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF6P18850 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF6P18850 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF6P18850 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF6P18850 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF6P18850 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF6P18850 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF6P18850 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF6P18850 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF6P18850 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF6P18850 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF6P18850 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF6P18850 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF6P18850 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF6P18850 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATF6P18850 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF6P18850 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF6P18850 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF6P18850 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF6P18850 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF6P18850 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF6P18850 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF6P18850 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF6P18850 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF6P18850 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATF6P18850 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF6P18850 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF6P18850 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF6P18850 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF6P18850 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF6P18850 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF6P18850 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF6P18850 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATF6P18850 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF6P18850 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF6P18850 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF6P18850 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF6P18850 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF6P18850 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF6P18850 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATF6P18850 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATF6P18850 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATF6P18850 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATF6P18850 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATF6P18850 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATF6P18850 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATF6P18850 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATF6P18850 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATF6P18850 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATF6P18850 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ATF6P18850 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATF6P18850 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATF6P18850 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATF6P18850 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATF6P18850 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATF6P18850 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATF6P18850 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATF6P18850 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATF6P18850 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATF6P18850 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATF6P18850 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATF6P18850 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATF6P18850 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATF6P18850 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATF6P18850 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATF6P18850 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATF6P18850 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATF6P18850 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ATF6P18850 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ATF6P18850 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATF6P18850 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ATF6P18850 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATF6P18850 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATF6P18850 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATF6P18850 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATF6P18850 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATF6P18850 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ATF6P18850 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATF6P18850 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATF6P18850 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATF6P18850 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATF6P18850 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATF6P18850 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATF6P18850 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATF6P18850 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATF6P18850 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATF6P18850 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATF6P18850 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATF6P18850 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF6P18850 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms