Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB6P18564 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB6P18564 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB6P18564 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB6P18564 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB6P18564 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB6P18564 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB6P18564 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB6P18564 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB6P18564 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB6P18564 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB6P18564 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB6P18564 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB6P18564 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB6P18564 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB6P18564 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB6P18564 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB6P18564 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB6P18564 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB6P18564 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB6P18564 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB6P18564 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB6P18564 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB6P18564 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB6P18564 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB6P18564 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB6P18564 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB6P18564 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB6P18564 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGB6P18564 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGB6P18564 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGB6P18564 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB6P18564 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGB6P18564 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGB6P18564 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGB6P18564 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB6P18564 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB6P18564 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB6P18564 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB6P18564 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB6P18564 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB6P18564 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB6P18564 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB6P18564 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB6P18564 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB6P18564 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB6P18564 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB6P18564 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB6P18564 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB6P18564 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms