Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARF4P18085 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARF4P18085 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ARF4P18085 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARF4P18085 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARF4P18085 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARF4P18085 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARF4P18085 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARF4P18085 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARF4P18085 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARF4P18085 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARF4P18085 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARF4P18085 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARF4P18085 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARF4P18085 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARF4P18085 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARF4P18085 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ARF4P18085 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARF4P18085 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARF4P18085 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARF4P18085 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARF4P18085 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARF4P18085 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ARF4P18085 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ARF4P18085 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARF4P18085 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARF4P18085 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARF4P18085 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARF4P18085 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARF4P18085 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ARF4P18085 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ARF4P18085 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ARF4P18085 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARF4P18085 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARF4P18085 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARF4P18085 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARF4P18085 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARF4P18085 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARF4P18085 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARF4P18085 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARF4P18085 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARF4P18085 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARF4P18085 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARF4P18085 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARF4P18085 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARF4P18085 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARF4P18085 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ARF4P18085 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARF4P18085 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARF4P18085 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARF4P18085 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARF4P18085 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARF4P18085 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARF4P18085 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARF4P18085 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARF4P18085 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARF4P18085 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARF4P18085 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARF4P18085 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ARF4P18085 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARF4P18085 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARF4P18085 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARF4P18085 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARF4P18085 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARF4P18085 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARF4P18085 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARF4P18085 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARF4P18085 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARF4P18085 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARF4P18085 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ARF4P18085 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ARF4P18085 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARF4P18085 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARF4P18085 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARF4P18085 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARF4P18085 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARF4P18085 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARF4P18085 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARF4P18085 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ARF4P18085 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARF4P18085 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARF4P18085 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARF4P18085 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARF4P18085 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARF4P18085 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARF4P18085 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARF4P18085 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARF4P18085 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARF4P18085 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARF4P18085 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARF4P18085 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ARF4P18085 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARF4P18085 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARF4P18085 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARF4P18085 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARF4P18085 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARF4P18085 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARF4P18085 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARF4P18085 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARF4P18085 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms