Protein–RNA interactions for Protein: P18074

ERCC2, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC2P18074 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC2P18074 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC2P18074 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC2P18074 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC2P18074 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC2P18074 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC2P18074 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC2P18074 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC2P18074 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERCC2P18074 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERCC2P18074 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERCC2P18074 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERCC2P18074 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERCC2P18074 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERCC2P18074 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERCC2P18074 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERCC2P18074 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERCC2P18074 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ERCC2P18074 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERCC2P18074 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ERCC2P18074 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERCC2P18074 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERCC2P18074 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERCC2P18074 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERCC2P18074 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERCC2P18074 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERCC2P18074 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ERCC2P18074 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ERCC2P18074 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERCC2P18074 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERCC2P18074 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERCC2P18074 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERCC2P18074 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERCC2P18074 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERCC2P18074 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERCC2P18074 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERCC2P18074 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERCC2P18074 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERCC2P18074 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERCC2P18074 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC2P18074 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC2P18074 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC2P18074 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC2P18074 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC2P18074 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC2P18074 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC2P18074 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC2P18074 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERCC2P18074 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERCC2P18074 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERCC2P18074 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERCC2P18074 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERCC2P18074 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERCC2P18074 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERCC2P18074 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERCC2P18074 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERCC2P18074 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERCC2P18074 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERCC2P18074 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ERCC2P18074 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERCC2P18074 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERCC2P18074 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERCC2P18074 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERCC2P18074 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERCC2P18074 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERCC2P18074 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERCC2P18074 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERCC2P18074 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERCC2P18074 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERCC2P18074 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERCC2P18074 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERCC2P18074 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERCC2P18074 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERCC2P18074 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERCC2P18074 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERCC2P18074 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERCC2P18074 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERCC2P18074 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERCC2P18074 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERCC2P18074 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERCC2P18074 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERCC2P18074 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERCC2P18074 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERCC2P18074 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERCC2P18074 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERCC2P18074 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERCC2P18074 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERCC2P18074 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERCC2P18074 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERCC2P18074 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERCC2P18074 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERCC2P18074 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ERCC2P18074 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ERCC2P18074 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ERCC2P18074 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERCC2P18074 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERCC2P18074 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERCC2P18074 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ERCC2P18074 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ERCC2P18074 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms