Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AMD1P17707 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
AMD1P17707 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
AMD1P17707 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
AMD1P17707 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AMD1P17707 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AMD1P17707 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
AMD1P17707 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
AMD1P17707 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMD1P17707 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMD1P17707 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMD1P17707 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMD1P17707 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMD1P17707 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMD1P17707 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMD1P17707 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMD1P17707 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMD1P17707 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMD1P17707 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMD1P17707 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AMD1P17707 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AMD1P17707 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AMD1P17707 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
AMD1P17707 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AMD1P17707 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AMD1P17707 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AMD1P17707 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMD1P17707 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMD1P17707 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMD1P17707 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMD1P17707 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMD1P17707 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMD1P17707 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMD1P17707 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
AMD1P17707 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMD1P17707 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMD1P17707 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMD1P17707 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMD1P17707 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMD1P17707 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMD1P17707 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AMD1P17707 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
AMD1P17707 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AMD1P17707 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AMD1P17707 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AMD1P17707 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AMD1P17707 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AMD1P17707 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AMD1P17707 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AMD1P17707 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AMD1P17707 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AMD1P17707 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AMD1P17707 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AMD1P17707 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AMD1P17707 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
AMD1P17707 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AMD1P17707 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AMD1P17707 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AMD1P17707 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AMD1P17707 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AMD1P17707 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AMD1P17707 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AMD1P17707 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AMD1P17707 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMD1P17707 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMD1P17707 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMD1P17707 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMD1P17707 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMD1P17707 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMD1P17707 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMD1P17707 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMD1P17707 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMD1P17707 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMD1P17707 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMD1P17707 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMD1P17707 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMD1P17707 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMD1P17707 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMD1P17707 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMD1P17707 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMD1P17707 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMD1P17707 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMD1P17707 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMD1P17707 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMD1P17707 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMD1P17707 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMD1P17707 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMD1P17707 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMD1P17707 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMD1P17707 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMD1P17707 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMD1P17707 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMD1P17707 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMD1P17707 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMD1P17707 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMD1P17707 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMD1P17707 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMD1P17707 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMD1P17707 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMD1P17707 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms