Protein–RNA interactions for Protein: P17677

GAP43, Neuromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAP43P17677 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GAP43P17677 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GAP43P17677 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GAP43P17677 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GAP43P17677 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GAP43P17677 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GAP43P17677 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GAP43P17677 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GAP43P17677 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GAP43P17677 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GAP43P17677 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GAP43P17677 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GAP43P17677 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GAP43P17677 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GAP43P17677 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GAP43P17677 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GAP43P17677 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GAP43P17677 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GAP43P17677 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GAP43P17677 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GAP43P17677 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GAP43P17677 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GAP43P17677 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GAP43P17677 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GAP43P17677 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GAP43P17677 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GAP43P17677 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GAP43P17677 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GAP43P17677 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GAP43P17677 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
GAP43P17677 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GAP43P17677 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GAP43P17677 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GAP43P17677 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GAP43P17677 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GAP43P17677 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GAP43P17677 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GAP43P17677 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GAP43P17677 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GAP43P17677 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GAP43P17677 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GAP43P17677 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GAP43P17677 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GAP43P17677 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GAP43P17677 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GAP43P17677 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GAP43P17677 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GAP43P17677 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GAP43P17677 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GAP43P17677 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GAP43P17677 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GAP43P17677 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GAP43P17677 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GAP43P17677 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GAP43P17677 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GAP43P17677 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GAP43P17677 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GAP43P17677 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GAP43P17677 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GAP43P17677 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GAP43P17677 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GAP43P17677 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GAP43P17677 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GAP43P17677 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GAP43P17677 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GAP43P17677 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GAP43P17677 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GAP43P17677 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GAP43P17677 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GAP43P17677 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GAP43P17677 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GAP43P17677 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GAP43P17677 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GAP43P17677 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GAP43P17677 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GAP43P17677 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GAP43P17677 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GAP43P17677 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GAP43P17677 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GAP43P17677 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GAP43P17677 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GAP43P17677 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GAP43P17677 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GAP43P17677 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GAP43P17677 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GAP43P17677 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GAP43P17677 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GAP43P17677 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GAP43P17677 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GAP43P17677 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GAP43P17677 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GAP43P17677 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GAP43P17677 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GAP43P17677 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GAP43P17677 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GAP43P17677 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GAP43P17677 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GAP43P17677 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GAP43P17677 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GAP43P17677 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms