Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDGFRAP16234 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDGFRAP16234 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDGFRAP16234 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDGFRAP16234 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDGFRAP16234 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDGFRAP16234 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDGFRAP16234 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDGFRAP16234 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDGFRAP16234 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PDGFRAP16234 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDGFRAP16234 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDGFRAP16234 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDGFRAP16234 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDGFRAP16234 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDGFRAP16234 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDGFRAP16234 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDGFRAP16234 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDGFRAP16234 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDGFRAP16234 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDGFRAP16234 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDGFRAP16234 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDGFRAP16234 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDGFRAP16234 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDGFRAP16234 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDGFRAP16234 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDGFRAP16234 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDGFRAP16234 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDGFRAP16234 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDGFRAP16234 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDGFRAP16234 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PDGFRAP16234 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDGFRAP16234 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDGFRAP16234 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDGFRAP16234 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDGFRAP16234 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDGFRAP16234 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDGFRAP16234 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDGFRAP16234 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDGFRAP16234 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDGFRAP16234 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDGFRAP16234 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDGFRAP16234 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDGFRAP16234 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDGFRAP16234 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDGFRAP16234 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDGFRAP16234 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDGFRAP16234 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDGFRAP16234 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PDGFRAP16234 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDGFRAP16234 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDGFRAP16234 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDGFRAP16234 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDGFRAP16234 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDGFRAP16234 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDGFRAP16234 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDGFRAP16234 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PDGFRAP16234 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDGFRAP16234 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDGFRAP16234 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDGFRAP16234 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDGFRAP16234 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDGFRAP16234 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDGFRAP16234 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDGFRAP16234 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDGFRAP16234 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDGFRAP16234 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PDGFRAP16234 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDGFRAP16234 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDGFRAP16234 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDGFRAP16234 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDGFRAP16234 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDGFRAP16234 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDGFRAP16234 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDGFRAP16234 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDGFRAP16234 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDGFRAP16234 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDGFRAP16234 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDGFRAP16234 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDGFRAP16234 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDGFRAP16234 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDGFRAP16234 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDGFRAP16234 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDGFRAP16234 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDGFRAP16234 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDGFRAP16234 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDGFRAP16234 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PDGFRAP16234 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PDGFRAP16234 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDGFRAP16234 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDGFRAP16234 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDGFRAP16234 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDGFRAP16234 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDGFRAP16234 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDGFRAP16234 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDGFRAP16234 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDGFRAP16234 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDGFRAP16234 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDGFRAP16234 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDGFRAP16234 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms