Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD46P15529 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CD46P15529 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD46P15529 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD46P15529 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD46P15529 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD46P15529 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD46P15529 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD46P15529 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD46P15529 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CD46P15529 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD46P15529 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD46P15529 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD46P15529 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD46P15529 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD46P15529 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD46P15529 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD46P15529 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD46P15529 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD46P15529 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD46P15529 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD46P15529 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD46P15529 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD46P15529 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD46P15529 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD46P15529 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD46P15529 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD46P15529 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD46P15529 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD46P15529 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD46P15529 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CD46P15529 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD46P15529 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD46P15529 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD46P15529 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD46P15529 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD46P15529 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD46P15529 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD46P15529 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD46P15529 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD46P15529 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD46P15529 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD46P15529 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD46P15529 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD46P15529 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD46P15529 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD46P15529 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD46P15529 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD46P15529 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD46P15529 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD46P15529 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD46P15529 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD46P15529 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CD46P15529 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD46P15529 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD46P15529 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD46P15529 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CD46P15529 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD46P15529 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD46P15529 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD46P15529 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD46P15529 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD46P15529 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD46P15529 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD46P15529 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD46P15529 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD46P15529 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD46P15529 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD46P15529 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD46P15529 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD46P15529 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD46P15529 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CD46P15529 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD46P15529 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD46P15529 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD46P15529 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CD46P15529 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD46P15529 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD46P15529 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CD46P15529 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CD46P15529 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD46P15529 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD46P15529 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD46P15529 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD46P15529 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD46P15529 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD46P15529 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD46P15529 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD46P15529 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD46P15529 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD46P15529 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD46P15529 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD46P15529 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD46P15529 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD46P15529 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD46P15529 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD46P15529 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD46P15529 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD46P15529 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD46P15529 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms