Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAV1P15498 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAV1P15498 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAV1P15498 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAV1P15498 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAV1P15498 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAV1P15498 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAV1P15498 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAV1P15498 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
VAV1P15498 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAV1P15498 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
VAV1P15498 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VAV1P15498 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VAV1P15498 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAV1P15498 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAV1P15498 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAV1P15498 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
VAV1P15498 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAV1P15498 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
VAV1P15498 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAV1P15498 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAV1P15498 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAV1P15498 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
VAV1P15498 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAV1P15498 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
VAV1P15498 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAV1P15498 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAV1P15498 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAV1P15498 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAV1P15498 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAV1P15498 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAV1P15498 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAV1P15498 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAV1P15498 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAV1P15498 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAV1P15498 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAV1P15498 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAV1P15498 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAV1P15498 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAV1P15498 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VAV1P15498 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
VAV1P15498 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VAV1P15498 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VAV1P15498 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VAV1P15498 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
VAV1P15498 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VAV1P15498 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VAV1P15498 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VAV1P15498 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VAV1P15498 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VAV1P15498 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VAV1P15498 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VAV1P15498 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
VAV1P15498 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VAV1P15498 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VAV1P15498 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VAV1P15498 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VAV1P15498 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VAV1P15498 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VAV1P15498 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VAV1P15498 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VAV1P15498 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VAV1P15498 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VAV1P15498 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
VAV1P15498 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VAV1P15498 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VAV1P15498 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAV1P15498 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAV1P15498 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAV1P15498 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAV1P15498 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAV1P15498 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAV1P15498 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAV1P15498 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAV1P15498 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAV1P15498 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAV1P15498 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAV1P15498 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VAV1P15498 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VAV1P15498 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VAV1P15498 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VAV1P15498 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VAV1P15498 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VAV1P15498 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VAV1P15498 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VAV1P15498 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VAV1P15498 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VAV1P15498 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VAV1P15498 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VAV1P15498 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VAV1P15498 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
VAV1P15498 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
VAV1P15498 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VAV1P15498 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VAV1P15498 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VAV1P15498 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VAV1P15498 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VAV1P15498 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VAV1P15498 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VAV1P15498 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms