Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC130P13994 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC130P13994 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC130P13994 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC130P13994 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC130P13994 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC130P13994 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC130P13994 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC130P13994 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC130P13994 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC130P13994 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC130P13994 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC130P13994 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC130P13994 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC130P13994 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC130P13994 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC130P13994 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC130P13994 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC130P13994 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC130P13994 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC130P13994 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC130P13994 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC130P13994 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC130P13994 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC130P13994 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC130P13994 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC130P13994 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC130P13994 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC130P13994 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC130P13994 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC130P13994 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC130P13994 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC130P13994 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC130P13994 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC130P13994 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC130P13994 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC130P13994 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC130P13994 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC130P13994 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC130P13994 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC130P13994 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC130P13994 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC130P13994 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC130P13994 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC130P13994 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC130P13994 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC130P13994 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC130P13994 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC130P13994 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC130P13994 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC130P13994 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC130P13994 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC130P13994 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC130P13994 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC130P13994 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC130P13994 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC130P13994 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC130P13994 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC130P13994 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC130P13994 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC130P13994 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC130P13994 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC130P13994 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC130P13994 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC130P13994 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC130P13994 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC130P13994 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC130P13994 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC130P13994 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC130P13994 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC130P13994 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC130P13994 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC130P13994 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC130P13994 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC130P13994 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC130P13994 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC130P13994 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC130P13994 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC130P13994 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC130P13994 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC130P13994 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC130P13994 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC130P13994 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC130P13994 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC130P13994 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC130P13994 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC130P13994 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC130P13994 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC130P13994 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC130P13994 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms