Protein–RNA interactions for Protein: P13797

PLS3, Plastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLS3P13797 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PLS3P13797 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PLS3P13797 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PLS3P13797 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PLS3P13797 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PLS3P13797 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PLS3P13797 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PLS3P13797 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PLS3P13797 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PLS3P13797 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PLS3P13797 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PLS3P13797 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PLS3P13797 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PLS3P13797 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PLS3P13797 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PLS3P13797 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PLS3P13797 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PLS3P13797 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PLS3P13797 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PLS3P13797 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PLS3P13797 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PLS3P13797 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PLS3P13797 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PLS3P13797 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PLS3P13797 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PLS3P13797 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PLS3P13797 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PLS3P13797 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PLS3P13797 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PLS3P13797 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PLS3P13797 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PLS3P13797 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PLS3P13797 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PLS3P13797 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PLS3P13797 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PLS3P13797 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PLS3P13797 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PLS3P13797 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PLS3P13797 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PLS3P13797 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PLS3P13797 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PLS3P13797 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PLS3P13797 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLS3P13797 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLS3P13797 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLS3P13797 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLS3P13797 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLS3P13797 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLS3P13797 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLS3P13797 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLS3P13797 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLS3P13797 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLS3P13797 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLS3P13797 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLS3P13797 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PLS3P13797 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PLS3P13797 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PLS3P13797 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PLS3P13797 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PLS3P13797 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLS3P13797 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLS3P13797 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLS3P13797 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLS3P13797 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PLS3P13797 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLS3P13797 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
PLS3P13797 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLS3P13797 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLS3P13797 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLS3P13797 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLS3P13797 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLS3P13797 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PLS3P13797 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PLS3P13797 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PLS3P13797 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PLS3P13797 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PLS3P13797 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PLS3P13797 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PLS3P13797 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PLS3P13797 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PLS3P13797 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PLS3P13797 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PLS3P13797 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PLS3P13797 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PLS3P13797 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PLS3P13797 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PLS3P13797 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLS3P13797 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLS3P13797 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLS3P13797 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLS3P13797 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLS3P13797 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLS3P13797 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLS3P13797 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLS3P13797 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLS3P13797 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLS3P13797 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLS3P13797 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLS3P13797 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLS3P13797 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200 ms