Protein–RNA interactions for Protein: P13473

LAMP2, Lysosome-associated membrane glycoprotein 2, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP2P13473 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMP2P13473 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMP2P13473 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMP2P13473 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMP2P13473 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMP2P13473 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMP2P13473 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMP2P13473 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMP2P13473 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMP2P13473 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMP2P13473 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMP2P13473 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMP2P13473 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMP2P13473 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMP2P13473 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMP2P13473 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMP2P13473 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMP2P13473 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMP2P13473 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMP2P13473 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMP2P13473 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMP2P13473 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMP2P13473 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMP2P13473 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMP2P13473 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
LAMP2P13473 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMP2P13473 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMP2P13473 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMP2P13473 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMP2P13473 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMP2P13473 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMP2P13473 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMP2P13473 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMP2P13473 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMP2P13473 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMP2P13473 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMP2P13473 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMP2P13473 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMP2P13473 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMP2P13473 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMP2P13473 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMP2P13473 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMP2P13473 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMP2P13473 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMP2P13473 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMP2P13473 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMP2P13473 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMP2P13473 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMP2P13473 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMP2P13473 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMP2P13473 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMP2P13473 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMP2P13473 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMP2P13473 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMP2P13473 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMP2P13473 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMP2P13473 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMP2P13473 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMP2P13473 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMP2P13473 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMP2P13473 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMP2P13473 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMP2P13473 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMP2P13473 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMP2P13473 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMP2P13473 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMP2P13473 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMP2P13473 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMP2P13473 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMP2P13473 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMP2P13473 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMP2P13473 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMP2P13473 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMP2P13473 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMP2P13473 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMP2P13473 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMP2P13473 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMP2P13473 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMP2P13473 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMP2P13473 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMP2P13473 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMP2P13473 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMP2P13473 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMP2P13473 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMP2P13473 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMP2P13473 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMP2P13473 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMP2P13473 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMP2P13473 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMP2P13473 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMP2P13473 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMP2P13473 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMP2P13473 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMP2P13473 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMP2P13473 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMP2P13473 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMP2P13473 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMP2P13473 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMP2P13473 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMP2P13473 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms