Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH1P12830 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH1P12830 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH1P12830 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH1P12830 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH1P12830 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH1P12830 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH1P12830 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH1P12830 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH1P12830 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH1P12830 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH1P12830 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH1P12830 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH1P12830 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH1P12830 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH1P12830 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH1P12830 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH1P12830 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH1P12830 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH1P12830 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH1P12830 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDH1P12830 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDH1P12830 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDH1P12830 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH1P12830 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH1P12830 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH1P12830 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH1P12830 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH1P12830 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH1P12830 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH1P12830 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH1P12830 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH1P12830 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH1P12830 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH1P12830 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH1P12830 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH1P12830 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH1P12830 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH1P12830 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH1P12830 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH1P12830 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH1P12830 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH1P12830 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH1P12830 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH1P12830 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH1P12830 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH1P12830 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH1P12830 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH1P12830 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH1P12830 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH1P12830 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH1P12830 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH1P12830 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH1P12830 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH1P12830 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH1P12830 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH1P12830 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH1P12830 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH1P12830 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH1P12830 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH1P12830 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH1P12830 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH1P12830 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH1P12830 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH1P12830 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH1P12830 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH1P12830 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH1P12830 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH1P12830 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH1P12830 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH1P12830 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH1P12830 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH1P12830 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH1P12830 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH1P12830 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH1P12830 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH1P12830 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH1P12830 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH1P12830 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH1P12830 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH1P12830 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH1P12830 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH1P12830 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH1P12830 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH1P12830 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH1P12830 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH1P12830 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH1P12830 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH1P12830 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH1P12830 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH1P12830 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH1P12830 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH1P12830 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH1P12830 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH1P12830 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH1P12830 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH1P12830 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH1P12830 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH1P12830 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH1P12830 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms