Protein–RNA interactions for Protein: P0DP24

CALM2, Calmodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM2P0DP24 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CALM2P0DP24 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CALM2P0DP24 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CALM2P0DP24 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CALM2P0DP24 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CALM2P0DP24 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CALM2P0DP24 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CALM2P0DP24 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CALM2P0DP24 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CALM2P0DP24 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CALM2P0DP24 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
CALM2P0DP24 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CALM2P0DP24 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CALM2P0DP24 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CALM2P0DP24 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CALM2P0DP24 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CALM2P0DP24 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CALM2P0DP24 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CALM2P0DP24 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CALM2P0DP24 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CALM2P0DP24 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CALM2P0DP24 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CALM2P0DP24 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CALM2P0DP24 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CALM2P0DP24 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CALM2P0DP24 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CALM2P0DP24 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CALM2P0DP24 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CALM2P0DP24 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CALM2P0DP24 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CALM2P0DP24 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CALM2P0DP24 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CALM2P0DP24 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CALM2P0DP24 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CALM2P0DP24 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CALM2P0DP24 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CALM2P0DP24 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CALM2P0DP24 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CALM2P0DP24 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CALM2P0DP24 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CALM2P0DP24 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CALM2P0DP24 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CALM2P0DP24 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CALM2P0DP24 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CALM2P0DP24 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CALM2P0DP24 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CALM2P0DP24 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CALM2P0DP24 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CALM2P0DP24 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CALM2P0DP24 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CALM2P0DP24 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CALM2P0DP24 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CALM2P0DP24 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CALM2P0DP24 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CALM2P0DP24 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CALM2P0DP24 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CALM2P0DP24 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CALM2P0DP24 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CALM2P0DP24 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CALM2P0DP24 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CALM2P0DP24 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CALM2P0DP24 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CALM2P0DP24 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CALM2P0DP24 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CALM2P0DP24 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CALM2P0DP24 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CALM2P0DP24 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CALM2P0DP24 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CALM2P0DP24 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CALM2P0DP24 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CALM2P0DP24 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CALM2P0DP24 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CALM2P0DP24 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CALM2P0DP24 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CALM2P0DP24 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CALM2P0DP24 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CALM2P0DP24 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CALM2P0DP24 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CALM2P0DP24 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CALM2P0DP24 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CALM2P0DP24 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CALM2P0DP24 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CALM2P0DP24 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CALM2P0DP24 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CALM2P0DP24 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CALM2P0DP24 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CALM2P0DP24 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CALM2P0DP24 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CALM2P0DP24 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CALM2P0DP24 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CALM2P0DP24 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CALM2P0DP24 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CALM2P0DP24 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CALM2P0DP24 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CALM2P0DP24 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CALM2P0DP24 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CALM2P0DP24 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CALM2P0DP24 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CALM2P0DP24 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CALM2P0DP24 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms