Protein–RNA interactions for Protein: P0DN78

OPN1MW3, Medium-wave-sensitive opsin 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1MW3P0DN78 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OPN1MW3P0DN78 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
OPN1MW3P0DN78 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
OPN1MW3P0DN78 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
OPN1MW3P0DN78 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OPN1MW3P0DN78 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
OPN1MW3P0DN78 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
OPN1MW3P0DN78 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
OPN1MW3P0DN78 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
OPN1MW3P0DN78 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OPN1MW3P0DN78 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OPN1MW3P0DN78 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
OPN1MW3P0DN78 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
OPN1MW3P0DN78 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
OPN1MW3P0DN78 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OPN1MW3P0DN78 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OPN1MW3P0DN78 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OPN1MW3P0DN78 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OPN1MW3P0DN78 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OPN1MW3P0DN78 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OPN1MW3P0DN78 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
OPN1MW3P0DN78 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OPN1MW3P0DN78 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
OPN1MW3P0DN78 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
OPN1MW3P0DN78 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
OPN1MW3P0DN78 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
OPN1MW3P0DN78 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
OPN1MW3P0DN78 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
OPN1MW3P0DN78 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OPN1MW3P0DN78 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OPN1MW3P0DN78 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OPN1MW3P0DN78 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
OPN1MW3P0DN78 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OPN1MW3P0DN78 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OPN1MW3P0DN78 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
OPN1MW3P0DN78 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OPN1MW3P0DN78 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
OPN1MW3P0DN78 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OPN1MW3P0DN78 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
OPN1MW3P0DN78 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
OPN1MW3P0DN78 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
OPN1MW3P0DN78 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
OPN1MW3P0DN78 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
OPN1MW3P0DN78 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
OPN1MW3P0DN78 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
OPN1MW3P0DN78 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
OPN1MW3P0DN78 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
OPN1MW3P0DN78 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 204.5 ms