Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC166P0CW27 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC166P0CW27 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC166P0CW27 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC166P0CW27 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC166P0CW27 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC166P0CW27 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC166P0CW27 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC166P0CW27 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC166P0CW27 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC166P0CW27 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC166P0CW27 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC166P0CW27 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC166P0CW27 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC166P0CW27 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC166P0CW27 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC166P0CW27 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC166P0CW27 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC166P0CW27 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC166P0CW27 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC166P0CW27 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC166P0CW27 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC166P0CW27 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC166P0CW27 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC166P0CW27 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC166P0CW27 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC166P0CW27 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC166P0CW27 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC166P0CW27 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC166P0CW27 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC166P0CW27 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC166P0CW27 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC166P0CW27 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC166P0CW27 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC166P0CW27 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC166P0CW27 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC166P0CW27 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC166P0CW27 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC166P0CW27 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC166P0CW27 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC166P0CW27 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC166P0CW27 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC166P0CW27 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC166P0CW27 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC166P0CW27 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC166P0CW27 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC166P0CW27 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC166P0CW27 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC166P0CW27 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC166P0CW27 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC166P0CW27 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC166P0CW27 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC166P0CW27 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC166P0CW27 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC166P0CW27 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC166P0CW27 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC166P0CW27 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC166P0CW27 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC166P0CW27 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC166P0CW27 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC166P0CW27 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC166P0CW27 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC166P0CW27 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC166P0CW27 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC166P0CW27 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC166P0CW27 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC166P0CW27 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC166P0CW27 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC166P0CW27 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC166P0CW27 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC166P0CW27 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC166P0CW27 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC166P0CW27 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC166P0CW27 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC166P0CW27 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC166P0CW27 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC166P0CW27 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC166P0CW27 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC166P0CW27 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC166P0CW27 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC166P0CW27 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC166P0CW27 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC166P0CW27 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC166P0CW27 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC166P0CW27 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC166P0CW27 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms