Protein–RNA interactions for Protein: P0CB38

PABPC4L, Polyadenylate-binding protein 4-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4LP0CB38 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPC4LP0CB38 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPC4LP0CB38 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPC4LP0CB38 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPC4LP0CB38 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPC4LP0CB38 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPC4LP0CB38 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPC4LP0CB38 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPC4LP0CB38 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC4LP0CB38 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC4LP0CB38 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC4LP0CB38 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC4LP0CB38 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC4LP0CB38 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC4LP0CB38 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC4LP0CB38 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC4LP0CB38 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC4LP0CB38 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC4LP0CB38 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC4LP0CB38 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC4LP0CB38 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC4LP0CB38 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC4LP0CB38 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC4LP0CB38 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC4LP0CB38 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC4LP0CB38 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC4LP0CB38 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC4LP0CB38 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC4LP0CB38 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC4LP0CB38 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC4LP0CB38 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC4LP0CB38 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC4LP0CB38 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC4LP0CB38 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC4LP0CB38 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC4LP0CB38 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PABPC4LP0CB38 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PABPC4LP0CB38 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PABPC4LP0CB38 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPC4LP0CB38 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PABPC4LP0CB38 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PABPC4LP0CB38 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PABPC4LP0CB38 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PABPC4LP0CB38 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms