Protein–RNA interactions for Protein: P0C7T8

TMEM253, Transmembrane protein 253, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM253P0C7T8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM253P0C7T8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM253P0C7T8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM253P0C7T8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM253P0C7T8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM253P0C7T8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM253P0C7T8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM253P0C7T8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM253P0C7T8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM253P0C7T8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM253P0C7T8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM253P0C7T8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM253P0C7T8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM253P0C7T8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM253P0C7T8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM253P0C7T8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM253P0C7T8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM253P0C7T8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM253P0C7T8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM253P0C7T8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TMEM253P0C7T8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM253P0C7T8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM253P0C7T8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM253P0C7T8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM253P0C7T8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM253P0C7T8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM253P0C7T8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM253P0C7T8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM253P0C7T8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM253P0C7T8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM253P0C7T8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM253P0C7T8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM253P0C7T8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM253P0C7T8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM253P0C7T8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM253P0C7T8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM253P0C7T8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM253P0C7T8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM253P0C7T8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM253P0C7T8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM253P0C7T8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM253P0C7T8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM253P0C7T8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM253P0C7T8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM253P0C7T8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM253P0C7T8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM253P0C7T8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM253P0C7T8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM253P0C7T8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMEM253P0C7T8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM253P0C7T8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM253P0C7T8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM253P0C7T8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM253P0C7T8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM253P0C7T8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM253P0C7T8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM253P0C7T8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM253P0C7T8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM253P0C7T8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM253P0C7T8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM253P0C7T8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM253P0C7T8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM253P0C7T8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM253P0C7T8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM253P0C7T8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM253P0C7T8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM253P0C7T8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM253P0C7T8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM253P0C7T8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM253P0C7T8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM253P0C7T8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM253P0C7T8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM253P0C7T8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM253P0C7T8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM253P0C7T8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM253P0C7T8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM253P0C7T8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM253P0C7T8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM253P0C7T8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM253P0C7T8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM253P0C7T8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM253P0C7T8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM253P0C7T8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM253P0C7T8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM253P0C7T8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM253P0C7T8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM253P0C7T8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM253P0C7T8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM253P0C7T8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM253P0C7T8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM253P0C7T8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM253P0C7T8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM253P0C7T8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM253P0C7T8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM253P0C7T8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM253P0C7T8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM253P0C7T8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM253P0C7T8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM253P0C7T8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM253P0C7T8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms