Protein–RNA interactions for Protein: P07948

LYN, Tyrosine-protein kinase Lyn, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNP07948 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LYNP07948 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LYNP07948 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LYNP07948 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LYNP07948 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LYNP07948 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LYNP07948 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LYNP07948 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LYNP07948 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LYNP07948 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LYNP07948 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LYNP07948 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LYNP07948 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LYNP07948 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYNP07948 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYNP07948 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYNP07948 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYNP07948 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYNP07948 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYNP07948 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LYNP07948 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYNP07948 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYNP07948 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYNP07948 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYNP07948 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYNP07948 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYNP07948 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LYNP07948 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LYNP07948 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LYNP07948 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LYNP07948 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LYNP07948 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LYNP07948 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LYNP07948 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LYNP07948 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LYNP07948 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LYNP07948 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LYNP07948 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LYNP07948 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LYNP07948 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LYNP07948 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LYNP07948 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYNP07948 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYNP07948 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYNP07948 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYNP07948 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LYNP07948 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYNP07948 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYNP07948 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYNP07948 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LYNP07948 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYNP07948 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYNP07948 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYNP07948 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYNP07948 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYNP07948 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LYNP07948 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LYNP07948 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYNP07948 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYNP07948 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYNP07948 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYNP07948 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYNP07948 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYNP07948 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYNP07948 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LYNP07948 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LYNP07948 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LYNP07948 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LYNP07948 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LYNP07948 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LYNP07948 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LYNP07948 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LYNP07948 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LYNP07948 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LYNP07948 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LYNP07948 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LYNP07948 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LYNP07948 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LYNP07948 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LYNP07948 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LYNP07948 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LYNP07948 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LYNP07948 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LYNP07948 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LYNP07948 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LYNP07948 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LYNP07948 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LYNP07948 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LYNP07948 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LYNP07948 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LYNP07948 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LYNP07948 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LYNP07948 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LYNP07948 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LYNP07948 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LYNP07948 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LYNP07948 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LYNP07948 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LYNP07948 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LYNP07948 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms