Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTMAP06454 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTMAP06454 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTMAP06454 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTMAP06454 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTMAP06454 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTMAP06454 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTMAP06454 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTMAP06454 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTMAP06454 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTMAP06454 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTMAP06454 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTMAP06454 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTMAP06454 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTMAP06454 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTMAP06454 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTMAP06454 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTMAP06454 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTMAP06454 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTMAP06454 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTMAP06454 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTMAP06454 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTMAP06454 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTMAP06454 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTMAP06454 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PTMAP06454 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PTMAP06454 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PTMAP06454 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PTMAP06454 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTMAP06454 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTMAP06454 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTMAP06454 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTMAP06454 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTMAP06454 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTMAP06454 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTMAP06454 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PTMAP06454 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTMAP06454 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTMAP06454 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTMAP06454 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTMAP06454 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTMAP06454 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTMAP06454 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTMAP06454 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTMAP06454 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTMAP06454 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTMAP06454 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTMAP06454 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PTMAP06454 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTMAP06454 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTMAP06454 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTMAP06454 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTMAP06454 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTMAP06454 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTMAP06454 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTMAP06454 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTMAP06454 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTMAP06454 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTMAP06454 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTMAP06454 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTMAP06454 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTMAP06454 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTMAP06454 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTMAP06454 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTMAP06454 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTMAP06454 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTMAP06454 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTMAP06454 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PTMAP06454 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTMAP06454 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTMAP06454 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTMAP06454 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTMAP06454 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTMAP06454 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTMAP06454 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTMAP06454 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTMAP06454 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTMAP06454 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTMAP06454 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTMAP06454 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTMAP06454 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTMAP06454 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTMAP06454 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTMAP06454 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTMAP06454 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTMAP06454 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTMAP06454 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTMAP06454 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PTMAP06454 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTMAP06454 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PTMAP06454 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTMAP06454 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTMAP06454 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTMAP06454 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTMAP06454 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTMAP06454 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTMAP06454 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTMAP06454 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTMAP06454 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTMAP06454 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms