Protein–RNA interactions for Protein: P05538

HLA-DQB2, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB2P05538 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HLA-DQB2P05538 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HLA-DQB2P05538 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HLA-DQB2P05538 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-DQB2P05538 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-DQB2P05538 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-DQB2P05538 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-DQB2P05538 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-DQB2P05538 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-DQB2P05538 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-DQB2P05538 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-DQB2P05538 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-DQB2P05538 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-DQB2P05538 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-DQB2P05538 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-DQB2P05538 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-DQB2P05538 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-DQB2P05538 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-DQB2P05538 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-DQB2P05538 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-DQB2P05538 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-DQB2P05538 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-DQB2P05538 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-DQB2P05538 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-DQB2P05538 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-DQB2P05538 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-DQB2P05538 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-DQB2P05538 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-DQB2P05538 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HLA-DQB2P05538 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-DQB2P05538 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HLA-DQB2P05538 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-DQB2P05538 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-DQB2P05538 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-DQB2P05538 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-DQB2P05538 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-DQB2P05538 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-DQB2P05538 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-DQB2P05538 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-DQB2P05538 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-DQB2P05538 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-DQB2P05538 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-DQB2P05538 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-DQB2P05538 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-DQB2P05538 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-DQB2P05538 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-DQB2P05538 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-DQB2P05538 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-DQB2P05538 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-DQB2P05538 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-DQB2P05538 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-DQB2P05538 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-DQB2P05538 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-DQB2P05538 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-DQB2P05538 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-DQB2P05538 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-DQB2P05538 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-DQB2P05538 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-DQB2P05538 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-DQB2P05538 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-DQB2P05538 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-DQB2P05538 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-DQB2P05538 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-DQB2P05538 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-DQB2P05538 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HLA-DQB2P05538 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-DQB2P05538 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-DQB2P05538 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-DQB2P05538 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-DQB2P05538 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-DQB2P05538 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-DQB2P05538 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-DQB2P05538 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-DQB2P05538 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-DQB2P05538 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-DQB2P05538 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-DQB2P05538 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-DQB2P05538 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-DQB2P05538 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-DQB2P05538 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-DQB2P05538 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-DQB2P05538 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-DQB2P05538 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-DQB2P05538 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-DQB2P05538 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-DQB2P05538 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-DQB2P05538 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-DQB2P05538 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-DQB2P05538 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-DQB2P05538 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-DQB2P05538 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-DQB2P05538 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-DQB2P05538 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-DQB2P05538 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-DQB2P05538 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-DQB2P05538 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-DQB2P05538 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-DQB2P05538 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-DQB2P05538 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-DQB2P05538 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms