Protein–RNA interactions for Protein: P05166

PCCB, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCBP05166 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PCCBP05166 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCCBP05166 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCCBP05166 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PCCBP05166 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PCCBP05166 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCCBP05166 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCCBP05166 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCCBP05166 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCCBP05166 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCCBP05166 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCCBP05166 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCCBP05166 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCCBP05166 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCCBP05166 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCCBP05166 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCCBP05166 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCCBP05166 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCCBP05166 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCCBP05166 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCCBP05166 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCCBP05166 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCCBP05166 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PCCBP05166 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCCBP05166 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCCBP05166 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCCBP05166 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCCBP05166 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCCBP05166 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCCBP05166 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCCBP05166 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCCBP05166 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCCBP05166 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCCBP05166 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCCBP05166 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCCBP05166 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCCBP05166 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCCBP05166 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCCBP05166 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCCBP05166 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PCCBP05166 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCCBP05166 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCCBP05166 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCCBP05166 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCCBP05166 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCCBP05166 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCCBP05166 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCCBP05166 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCCBP05166 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PCCBP05166 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCCBP05166 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PCCBP05166 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCCBP05166 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCCBP05166 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCCBP05166 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCCBP05166 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCCBP05166 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCCBP05166 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PCCBP05166 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PCCBP05166 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCCBP05166 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCCBP05166 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PCCBP05166 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PCCBP05166 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCCBP05166 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCCBP05166 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCCBP05166 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCCBP05166 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCCBP05166 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCCBP05166 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCCBP05166 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCCBP05166 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCCBP05166 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCCBP05166 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PCCBP05166 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCCBP05166 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCCBP05166 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCCBP05166 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCCBP05166 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCCBP05166 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCCBP05166 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCCBP05166 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCCBP05166 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCCBP05166 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCCBP05166 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCCBP05166 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCCBP05166 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCCBP05166 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PCCBP05166 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PCCBP05166 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCCBP05166 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCCBP05166 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCCBP05166 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCCBP05166 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCCBP05166 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCCBP05166 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCCBP05166 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCCBP05166 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PCCBP05166 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCCBP05166 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms