Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYCNP04198 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYCNP04198 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYCNP04198 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYCNP04198 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYCNP04198 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
MYCNP04198 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYCNP04198 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
MYCNP04198 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYCNP04198 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYCNP04198 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYCNP04198 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYCNP04198 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYCNP04198 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYCNP04198 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYCNP04198 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYCNP04198 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYCNP04198 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYCNP04198 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYCNP04198 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYCNP04198 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYCNP04198 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MYCNP04198 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYCNP04198 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYCNP04198 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYCNP04198 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYCNP04198 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYCNP04198 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYCNP04198 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYCNP04198 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYCNP04198 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYCNP04198 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYCNP04198 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYCNP04198 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MYCNP04198 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MYCNP04198 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
MYCNP04198 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYCNP04198 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYCNP04198 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYCNP04198 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYCNP04198 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYCNP04198 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYCNP04198 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYCNP04198 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYCNP04198 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYCNP04198 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYCNP04198 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYCNP04198 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYCNP04198 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYCNP04198 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYCNP04198 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYCNP04198 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYCNP04198 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYCNP04198 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYCNP04198 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYCNP04198 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYCNP04198 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYCNP04198 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYCNP04198 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYCNP04198 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYCNP04198 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYCNP04198 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
MYCNP04198 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYCNP04198 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYCNP04198 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYCNP04198 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYCNP04198 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYCNP04198 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYCNP04198 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MYCNP04198 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYCNP04198 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYCNP04198 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYCNP04198 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYCNP04198 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYCNP04198 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYCNP04198 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYCNP04198 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYCNP04198 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYCNP04198 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYCNP04198 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYCNP04198 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYCNP04198 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYCNP04198 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYCNP04198 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
MYCNP04198 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYCNP04198 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYCNP04198 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MYCNP04198 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MYCNP04198 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MYCNP04198 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MYCNP04198 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MYCNP04198 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MYCNP04198 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MYCNP04198 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MYCNP04198 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MYCNP04198 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MYCNP04198 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MYCNP04198 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MYCNP04198 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
MYCNP04198 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms