Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOC3P02656 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOC3P02656 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOC3P02656 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOC3P02656 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
APOC3P02656 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOC3P02656 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOC3P02656 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOC3P02656 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOC3P02656 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOC3P02656 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOC3P02656 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
APOC3P02656 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOC3P02656 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOC3P02656 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOC3P02656 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOC3P02656 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOC3P02656 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOC3P02656 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOC3P02656 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOC3P02656 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOC3P02656 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOC3P02656 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOC3P02656 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOC3P02656 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOC3P02656 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOC3P02656 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOC3P02656 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOC3P02656 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOC3P02656 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
APOC3P02656 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOC3P02656 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOC3P02656 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOC3P02656 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOC3P02656 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOC3P02656 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOC3P02656 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOC3P02656 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOC3P02656 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOC3P02656 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOC3P02656 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOC3P02656 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOC3P02656 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOC3P02656 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOC3P02656 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOC3P02656 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOC3P02656 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOC3P02656 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOC3P02656 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOC3P02656 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOC3P02656 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOC3P02656 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOC3P02656 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOC3P02656 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOC3P02656 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOC3P02656 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOC3P02656 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOC3P02656 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOC3P02656 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
APOC3P02656 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOC3P02656 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOC3P02656 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
APOC3P02656 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOC3P02656 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOC3P02656 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOC3P02656 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOC3P02656 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOC3P02656 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOC3P02656 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOC3P02656 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOC3P02656 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOC3P02656 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOC3P02656 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOC3P02656 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOC3P02656 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
APOC3P02656 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOC3P02656 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOC3P02656 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOC3P02656 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOC3P02656 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOC3P02656 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOC3P02656 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOC3P02656 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOC3P02656 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
APOC3P02656 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
APOC3P02656 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOC3P02656 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOC3P02656 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOC3P02656 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19■□□□□ 0.63
APOC3P02656 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
APOC3P02656 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
APOC3P02656 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOC3P02656 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19■□□□□ 0.63
APOC3P02656 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOC3P02656 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOC3P02656 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOC3P02656 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOC3P02656 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOC3P02656 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOC3P02656 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms