Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HLA-DQB1P01920 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-DQB1P01920 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HLA-DQB1P01920 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HLA-DQB1P01920 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HLA-DQB1P01920 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HLA-DQB1P01920 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HLA-DQB1P01920 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-DQB1P01920 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-DQB1P01920 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-DQB1P01920 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-DQB1P01920 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-DQB1P01920 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-DQB1P01920 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-DQB1P01920 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-DQB1P01920 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-DQB1P01920 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-DQB1P01920 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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