Protein–RNA interactions for Protein: O95935

TBX18, T-box transcription factor TBX18, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX18O95935 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TBX18O95935 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TBX18O95935 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TBX18O95935 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TBX18O95935 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TBX18O95935 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TBX18O95935 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TBX18O95935 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TBX18O95935 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TBX18O95935 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TBX18O95935 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TBX18O95935 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TBX18O95935 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TBX18O95935 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TBX18O95935 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TBX18O95935 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TBX18O95935 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TBX18O95935 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TBX18O95935 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TBX18O95935 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TBX18O95935 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TBX18O95935 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TBX18O95935 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TBX18O95935 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TBX18O95935 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TBX18O95935 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TBX18O95935 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TBX18O95935 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TBX18O95935 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TBX18O95935 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TBX18O95935 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TBX18O95935 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TBX18O95935 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TBX18O95935 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TBX18O95935 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TBX18O95935 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TBX18O95935 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TBX18O95935 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TBX18O95935 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TBX18O95935 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TBX18O95935 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TBX18O95935 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TBX18O95935 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TBX18O95935 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TBX18O95935 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TBX18O95935 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TBX18O95935 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TBX18O95935 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TBX18O95935 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TBX18O95935 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TBX18O95935 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TBX18O95935 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TBX18O95935 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TBX18O95935 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TBX18O95935 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TBX18O95935 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TBX18O95935 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TBX18O95935 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TBX18O95935 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TBX18O95935 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TBX18O95935 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TBX18O95935 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TBX18O95935 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TBX18O95935 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TBX18O95935 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TBX18O95935 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TBX18O95935 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TBX18O95935 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TBX18O95935 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TBX18O95935 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TBX18O95935 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TBX18O95935 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TBX18O95935 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TBX18O95935 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TBX18O95935 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TBX18O95935 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TBX18O95935 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TBX18O95935 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TBX18O95935 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TBX18O95935 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TBX18O95935 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TBX18O95935 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TBX18O95935 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TBX18O95935 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TBX18O95935 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TBX18O95935 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TBX18O95935 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TBX18O95935 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TBX18O95935 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TBX18O95935 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TBX18O95935 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TBX18O95935 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TBX18O95935 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TBX18O95935 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TBX18O95935 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
TBX18O95935 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TBX18O95935 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TBX18O95935 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TBX18O95935 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TBX18O95935 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms