Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SEC24BO95487 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SEC24BO95487 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SEC24BO95487 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SEC24BO95487 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SEC24BO95487 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SEC24BO95487 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SEC24BO95487 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SEC24BO95487 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SEC24BO95487 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SEC24BO95487 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SEC24BO95487 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SEC24BO95487 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SEC24BO95487 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SEC24BO95487 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SEC24BO95487 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SEC24BO95487 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SEC24BO95487 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SEC24BO95487 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SEC24BO95487 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SEC24BO95487 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SEC24BO95487 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SEC24BO95487 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SEC24BO95487 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SEC24BO95487 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SEC24BO95487 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SEC24BO95487 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SEC24BO95487 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SEC24BO95487 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SEC24BO95487 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SEC24BO95487 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SEC24BO95487 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SEC24BO95487 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SEC24BO95487 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SEC24BO95487 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SEC24BO95487 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SEC24BO95487 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SEC24BO95487 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SEC24BO95487 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SEC24BO95487 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SEC24BO95487 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SEC24BO95487 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SEC24BO95487 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SEC24BO95487 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SEC24BO95487 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SEC24BO95487 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SEC24BO95487 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SEC24BO95487 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SEC24BO95487 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SEC24BO95487 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SEC24BO95487 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SEC24BO95487 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SEC24BO95487 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SEC24BO95487 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SEC24BO95487 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SEC24BO95487 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SEC24BO95487 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SEC24BO95487 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SEC24BO95487 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms