Protein–RNA interactions for Protein: O95155

UBE4B, Ubiquitin conjugation factor E4 B, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4BO95155 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE4BO95155 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE4BO95155 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE4BO95155 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE4BO95155 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE4BO95155 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE4BO95155 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE4BO95155 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE4BO95155 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE4BO95155 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE4BO95155 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE4BO95155 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE4BO95155 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE4BO95155 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE4BO95155 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE4BO95155 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE4BO95155 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE4BO95155 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE4BO95155 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE4BO95155 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE4BO95155 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE4BO95155 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE4BO95155 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE4BO95155 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE4BO95155 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE4BO95155 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE4BO95155 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE4BO95155 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE4BO95155 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE4BO95155 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE4BO95155 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBE4BO95155 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBE4BO95155 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
UBE4BO95155 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
UBE4BO95155 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
UBE4BO95155 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
UBE4BO95155 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE4BO95155 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE4BO95155 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE4BO95155 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE4BO95155 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE4BO95155 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE4BO95155 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE4BO95155 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE4BO95155 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE4BO95155 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE4BO95155 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE4BO95155 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE4BO95155 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE4BO95155 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE4BO95155 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE4BO95155 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE4BO95155 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE4BO95155 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE4BO95155 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE4BO95155 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE4BO95155 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE4BO95155 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE4BO95155 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE4BO95155 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE4BO95155 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE4BO95155 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE4BO95155 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE4BO95155 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE4BO95155 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE4BO95155 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE4BO95155 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE4BO95155 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE4BO95155 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE4BO95155 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE4BO95155 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE4BO95155 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE4BO95155 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE4BO95155 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE4BO95155 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE4BO95155 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE4BO95155 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE4BO95155 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE4BO95155 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE4BO95155 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
UBE4BO95155 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE4BO95155 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE4BO95155 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE4BO95155 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE4BO95155 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE4BO95155 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE4BO95155 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE4BO95155 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE4BO95155 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE4BO95155 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE4BO95155 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE4BO95155 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE4BO95155 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE4BO95155 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE4BO95155 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE4BO95155 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE4BO95155 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE4BO95155 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE4BO95155 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE4BO95155 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms