Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DCTN3O75935 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DCTN3O75935 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DCTN3O75935 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
DCTN3O75935 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCTN3O75935 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCTN3O75935 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCTN3O75935 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCTN3O75935 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCTN3O75935 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCTN3O75935 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCTN3O75935 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCTN3O75935 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCTN3O75935 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCTN3O75935 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCTN3O75935 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DCTN3O75935 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCTN3O75935 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCTN3O75935 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCTN3O75935 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCTN3O75935 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCTN3O75935 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCTN3O75935 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCTN3O75935 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCTN3O75935 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCTN3O75935 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCTN3O75935 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCTN3O75935 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCTN3O75935 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCTN3O75935 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCTN3O75935 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCTN3O75935 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCTN3O75935 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DCTN3O75935 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCTN3O75935 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCTN3O75935 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCTN3O75935 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCTN3O75935 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCTN3O75935 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCTN3O75935 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCTN3O75935 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCTN3O75935 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DCTN3O75935 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DCTN3O75935 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DCTN3O75935 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DCTN3O75935 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCTN3O75935 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCTN3O75935 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCTN3O75935 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCTN3O75935 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCTN3O75935 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCTN3O75935 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCTN3O75935 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCTN3O75935 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCTN3O75935 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCTN3O75935 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCTN3O75935 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCTN3O75935 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCTN3O75935 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCTN3O75935 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCTN3O75935 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCTN3O75935 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCTN3O75935 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCTN3O75935 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCTN3O75935 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCTN3O75935 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCTN3O75935 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCTN3O75935 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCTN3O75935 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCTN3O75935 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCTN3O75935 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCTN3O75935 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCTN3O75935 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCTN3O75935 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCTN3O75935 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCTN3O75935 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCTN3O75935 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCTN3O75935 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCTN3O75935 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCTN3O75935 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCTN3O75935 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCTN3O75935 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DCTN3O75935 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCTN3O75935 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCTN3O75935 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCTN3O75935 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCTN3O75935 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCTN3O75935 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCTN3O75935 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCTN3O75935 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCTN3O75935 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCTN3O75935 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCTN3O75935 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCTN3O75935 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCTN3O75935 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCTN3O75935 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DCTN3O75935 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCTN3O75935 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCTN3O75935 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCTN3O75935 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms