Protein–RNA interactions for Protein: O75901

RASSF9, Ras association domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF9O75901 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RASSF9O75901 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RASSF9O75901 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RASSF9O75901 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RASSF9O75901 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RASSF9O75901 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RASSF9O75901 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RASSF9O75901 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RASSF9O75901 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RASSF9O75901 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RASSF9O75901 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RASSF9O75901 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RASSF9O75901 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RASSF9O75901 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RASSF9O75901 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RASSF9O75901 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RASSF9O75901 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RASSF9O75901 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RASSF9O75901 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RASSF9O75901 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RASSF9O75901 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RASSF9O75901 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RASSF9O75901 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RASSF9O75901 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RASSF9O75901 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RASSF9O75901 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RASSF9O75901 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RASSF9O75901 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RASSF9O75901 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RASSF9O75901 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RASSF9O75901 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RASSF9O75901 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RASSF9O75901 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RASSF9O75901 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RASSF9O75901 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RASSF9O75901 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RASSF9O75901 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RASSF9O75901 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RASSF9O75901 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RASSF9O75901 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RASSF9O75901 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RASSF9O75901 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RASSF9O75901 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RASSF9O75901 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RASSF9O75901 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RASSF9O75901 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RASSF9O75901 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RASSF9O75901 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RASSF9O75901 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RASSF9O75901 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RASSF9O75901 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RASSF9O75901 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RASSF9O75901 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RASSF9O75901 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RASSF9O75901 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RASSF9O75901 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RASSF9O75901 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RASSF9O75901 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RASSF9O75901 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RASSF9O75901 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RASSF9O75901 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RASSF9O75901 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RASSF9O75901 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RASSF9O75901 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RASSF9O75901 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RASSF9O75901 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RASSF9O75901 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RASSF9O75901 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RASSF9O75901 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RASSF9O75901 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RASSF9O75901 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RASSF9O75901 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RASSF9O75901 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RASSF9O75901 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RASSF9O75901 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RASSF9O75901 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RASSF9O75901 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RASSF9O75901 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RASSF9O75901 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASSF9O75901 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASSF9O75901 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASSF9O75901 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RASSF9O75901 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASSF9O75901 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RASSF9O75901 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASSF9O75901 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASSF9O75901 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASSF9O75901 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASSF9O75901 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASSF9O75901 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASSF9O75901 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RASSF9O75901 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms