Protein–RNA interactions for Protein: O75603

GCM2, Chorion-specific transcription factor GCMb, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCM2O75603 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCM2O75603 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCM2O75603 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCM2O75603 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCM2O75603 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GCM2O75603 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCM2O75603 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCM2O75603 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCM2O75603 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCM2O75603 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCM2O75603 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCM2O75603 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCM2O75603 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCM2O75603 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCM2O75603 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCM2O75603 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GCM2O75603 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCM2O75603 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCM2O75603 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCM2O75603 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCM2O75603 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCM2O75603 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCM2O75603 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCM2O75603 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCM2O75603 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCM2O75603 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCM2O75603 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCM2O75603 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCM2O75603 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCM2O75603 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCM2O75603 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCM2O75603 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCM2O75603 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCM2O75603 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCM2O75603 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCM2O75603 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCM2O75603 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCM2O75603 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCM2O75603 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCM2O75603 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCM2O75603 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCM2O75603 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCM2O75603 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCM2O75603 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCM2O75603 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCM2O75603 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GCM2O75603 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GCM2O75603 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCM2O75603 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCM2O75603 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCM2O75603 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GCM2O75603 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCM2O75603 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCM2O75603 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCM2O75603 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCM2O75603 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCM2O75603 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCM2O75603 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCM2O75603 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCM2O75603 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCM2O75603 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCM2O75603 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCM2O75603 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCM2O75603 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCM2O75603 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCM2O75603 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GCM2O75603 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCM2O75603 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCM2O75603 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCM2O75603 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCM2O75603 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCM2O75603 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GCM2O75603 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCM2O75603 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCM2O75603 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCM2O75603 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GCM2O75603 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCM2O75603 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GCM2O75603 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCM2O75603 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCM2O75603 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCM2O75603 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCM2O75603 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCM2O75603 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCM2O75603 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCM2O75603 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCM2O75603 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCM2O75603 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCM2O75603 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCM2O75603 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCM2O75603 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCM2O75603 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCM2O75603 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCM2O75603 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCM2O75603 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCM2O75603 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCM2O75603 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCM2O75603 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCM2O75603 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCM2O75603 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms