Protein–RNA interactions for Protein: O75596

CLEC3A, C-type lectin domain family 3 member A, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC3AO75596 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLEC3AO75596 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLEC3AO75596 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLEC3AO75596 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLEC3AO75596 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLEC3AO75596 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CLEC3AO75596 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLEC3AO75596 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLEC3AO75596 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLEC3AO75596 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLEC3AO75596 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLEC3AO75596 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLEC3AO75596 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLEC3AO75596 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLEC3AO75596 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLEC3AO75596 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLEC3AO75596 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLEC3AO75596 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLEC3AO75596 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLEC3AO75596 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLEC3AO75596 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLEC3AO75596 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLEC3AO75596 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLEC3AO75596 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLEC3AO75596 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLEC3AO75596 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLEC3AO75596 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLEC3AO75596 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLEC3AO75596 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLEC3AO75596 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLEC3AO75596 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLEC3AO75596 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLEC3AO75596 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLEC3AO75596 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLEC3AO75596 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLEC3AO75596 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLEC3AO75596 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLEC3AO75596 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLEC3AO75596 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLEC3AO75596 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLEC3AO75596 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLEC3AO75596 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLEC3AO75596 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLEC3AO75596 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLEC3AO75596 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms