Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MARCH6O60337 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MARCH6O60337 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MARCH6O60337 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MARCH6O60337 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MARCH6O60337 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MARCH6O60337 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MARCH6O60337 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MARCH6O60337 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MARCH6O60337 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MARCH6O60337 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
MARCH6O60337 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MARCH6O60337 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MARCH6O60337 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MARCH6O60337 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MARCH6O60337 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MARCH6O60337 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MARCH6O60337 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MARCH6O60337 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MARCH6O60337 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MARCH6O60337 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MARCH6O60337 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MARCH6O60337 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MARCH6O60337 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MARCH6O60337 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MARCH6O60337 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MARCH6O60337 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MARCH6O60337 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MARCH6O60337 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MARCH6O60337 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MARCH6O60337 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MARCH6O60337 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MARCH6O60337 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MARCH6O60337 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MARCH6O60337 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MARCH6O60337 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MARCH6O60337 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MARCH6O60337 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MARCH6O60337 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MARCH6O60337 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MARCH6O60337 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MARCH6O60337 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MARCH6O60337 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MARCH6O60337 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
MARCH6O60337 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MARCH6O60337 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MARCH6O60337 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MARCH6O60337 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
MARCH6O60337 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
MARCH6O60337 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MARCH6O60337 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MARCH6O60337 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MARCH6O60337 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MARCH6O60337 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MARCH6O60337 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MARCH6O60337 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MARCH6O60337 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MARCH6O60337 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MARCH6O60337 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MARCH6O60337 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MARCH6O60337 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MARCH6O60337 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MARCH6O60337 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MARCH6O60337 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MARCH6O60337 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MARCH6O60337 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MARCH6O60337 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MARCH6O60337 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MARCH6O60337 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MARCH6O60337 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MARCH6O60337 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MARCH6O60337 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MARCH6O60337 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MARCH6O60337 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MARCH6O60337 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MARCH6O60337 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MARCH6O60337 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MARCH6O60337 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MARCH6O60337 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
MARCH6O60337 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MARCH6O60337 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MARCH6O60337 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MARCH6O60337 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MARCH6O60337 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MARCH6O60337 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MARCH6O60337 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MARCH6O60337 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MARCH6O60337 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MARCH6O60337 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MARCH6O60337 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MARCH6O60337 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MARCH6O60337 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MARCH6O60337 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
MARCH6O60337 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MARCH6O60337 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MARCH6O60337 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MARCH6O60337 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MARCH6O60337 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MARCH6O60337 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MARCH6O60337 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms