Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAK2O60296 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAK2O60296 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAK2O60296 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAK2O60296 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAK2O60296 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAK2O60296 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAK2O60296 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAK2O60296 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAK2O60296 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAK2O60296 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAK2O60296 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAK2O60296 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAK2O60296 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAK2O60296 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAK2O60296 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAK2O60296 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAK2O60296 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAK2O60296 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAK2O60296 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAK2O60296 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAK2O60296 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAK2O60296 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAK2O60296 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAK2O60296 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAK2O60296 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAK2O60296 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAK2O60296 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAK2O60296 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAK2O60296 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAK2O60296 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAK2O60296 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAK2O60296 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRAK2O60296 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRAK2O60296 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRAK2O60296 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAK2O60296 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAK2O60296 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAK2O60296 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAK2O60296 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAK2O60296 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAK2O60296 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAK2O60296 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAK2O60296 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAK2O60296 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAK2O60296 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAK2O60296 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAK2O60296 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAK2O60296 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAK2O60296 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAK2O60296 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAK2O60296 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAK2O60296 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAK2O60296 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAK2O60296 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAK2O60296 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAK2O60296 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAK2O60296 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAK2O60296 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAK2O60296 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAK2O60296 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAK2O60296 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAK2O60296 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAK2O60296 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAK2O60296 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAK2O60296 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAK2O60296 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAK2O60296 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAK2O60296 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAK2O60296 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAK2O60296 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
TRAK2O60296 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAK2O60296 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAK2O60296 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRAK2O60296 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAK2O60296 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAK2O60296 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAK2O60296 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAK2O60296 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAK2O60296 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAK2O60296 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAK2O60296 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRAK2O60296 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TRAK2O60296 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAK2O60296 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAK2O60296 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAK2O60296 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAK2O60296 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAK2O60296 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAK2O60296 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAK2O60296 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAK2O60296 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAK2O60296 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAK2O60296 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAK2O60296 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAK2O60296 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAK2O60296 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAK2O60296 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAK2O60296 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
TRAK2O60296 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms