Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EXTL3O43909 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EXTL3O43909 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EXTL3O43909 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EXTL3O43909 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EXTL3O43909 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EXTL3O43909 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EXTL3O43909 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EXTL3O43909 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EXTL3O43909 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EXTL3O43909 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EXTL3O43909 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
EXTL3O43909 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EXTL3O43909 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EXTL3O43909 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
EXTL3O43909 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EXTL3O43909 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EXTL3O43909 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
EXTL3O43909 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EXTL3O43909 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EXTL3O43909 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
EXTL3O43909 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EXTL3O43909 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EXTL3O43909 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EXTL3O43909 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
EXTL3O43909 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EXTL3O43909 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EXTL3O43909 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EXTL3O43909 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EXTL3O43909 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EXTL3O43909 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
EXTL3O43909 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EXTL3O43909 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EXTL3O43909 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EXTL3O43909 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EXTL3O43909 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EXTL3O43909 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EXTL3O43909 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EXTL3O43909 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EXTL3O43909 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EXTL3O43909 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EXTL3O43909 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EXTL3O43909 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EXTL3O43909 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EXTL3O43909 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EXTL3O43909 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms