Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP9O43818 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP9O43818 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP9O43818 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP9O43818 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP9O43818 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP9O43818 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP9O43818 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP9O43818 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP9O43818 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP9O43818 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP9O43818 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP9O43818 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP9O43818 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP9O43818 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP9O43818 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP9O43818 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP9O43818 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RRP9O43818 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRP9O43818 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRP9O43818 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRP9O43818 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRP9O43818 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRP9O43818 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRP9O43818 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRP9O43818 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRP9O43818 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP9O43818 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP9O43818 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP9O43818 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP9O43818 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP9O43818 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP9O43818 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP9O43818 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP9O43818 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP9O43818 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP9O43818 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP9O43818 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP9O43818 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP9O43818 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP9O43818 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP9O43818 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP9O43818 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP9O43818 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP9O43818 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP9O43818 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP9O43818 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP9O43818 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP9O43818 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP9O43818 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP9O43818 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP9O43818 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP9O43818 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP9O43818 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP9O43818 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP9O43818 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP9O43818 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP9O43818 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP9O43818 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP9O43818 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP9O43818 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP9O43818 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP9O43818 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP9O43818 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP9O43818 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP9O43818 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP9O43818 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP9O43818 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP9O43818 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP9O43818 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP9O43818 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP9O43818 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP9O43818 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP9O43818 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP9O43818 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP9O43818 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP9O43818 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP9O43818 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP9O43818 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP9O43818 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP9O43818 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP9O43818 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP9O43818 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP9O43818 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRP9O43818 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRP9O43818 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRP9O43818 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRP9O43818 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RRP9O43818 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRP9O43818 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRP9O43818 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRP9O43818 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRP9O43818 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRP9O43818 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRP9O43818 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRP9O43818 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRP9O43818 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RRP9O43818 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRP9O43818 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRP9O43818 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.9 ms