Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC25A20O43772 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC25A20O43772 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC25A20O43772 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC25A20O43772 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC25A20O43772 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC25A20O43772 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC25A20O43772 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC25A20O43772 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC25A20O43772 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC25A20O43772 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC25A20O43772 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC25A20O43772 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC25A20O43772 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC25A20O43772 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC25A20O43772 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC25A20O43772 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC25A20O43772 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC25A20O43772 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC25A20O43772 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC25A20O43772 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC25A20O43772 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC25A20O43772 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC25A20O43772 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A20O43772 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A20O43772 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A20O43772 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A20O43772 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A20O43772 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A20O43772 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A20O43772 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A20O43772 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A20O43772 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms