Protein–RNA interactions for Protein: O43709

BUD23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD23O43709 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BUD23O43709 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BUD23O43709 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
BUD23O43709 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BUD23O43709 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BUD23O43709 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BUD23O43709 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BUD23O43709 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BUD23O43709 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BUD23O43709 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BUD23O43709 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BUD23O43709 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BUD23O43709 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BUD23O43709 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BUD23O43709 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BUD23O43709 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BUD23O43709 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BUD23O43709 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BUD23O43709 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BUD23O43709 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BUD23O43709 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BUD23O43709 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BUD23O43709 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BUD23O43709 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
BUD23O43709 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BUD23O43709 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
BUD23O43709 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BUD23O43709 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BUD23O43709 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BUD23O43709 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BUD23O43709 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BUD23O43709 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BUD23O43709 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
BUD23O43709 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BUD23O43709 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BUD23O43709 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BUD23O43709 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BUD23O43709 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BUD23O43709 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BUD23O43709 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BUD23O43709 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BUD23O43709 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BUD23O43709 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BUD23O43709 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BUD23O43709 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BUD23O43709 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BUD23O43709 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BUD23O43709 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BUD23O43709 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BUD23O43709 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BUD23O43709 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BUD23O43709 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BUD23O43709 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BUD23O43709 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BUD23O43709 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BUD23O43709 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BUD23O43709 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BUD23O43709 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BUD23O43709 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BUD23O43709 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BUD23O43709 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BUD23O43709 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BUD23O43709 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BUD23O43709 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BUD23O43709 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BUD23O43709 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BUD23O43709 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
BUD23O43709 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BUD23O43709 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BUD23O43709 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BUD23O43709 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BUD23O43709 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BUD23O43709 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BUD23O43709 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BUD23O43709 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BUD23O43709 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BUD23O43709 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BUD23O43709 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BUD23O43709 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BUD23O43709 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BUD23O43709 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BUD23O43709 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BUD23O43709 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BUD23O43709 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BUD23O43709 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BUD23O43709 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BUD23O43709 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BUD23O43709 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BUD23O43709 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BUD23O43709 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BUD23O43709 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BUD23O43709 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BUD23O43709 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
BUD23O43709 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
BUD23O43709 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BUD23O43709 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
BUD23O43709 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BUD23O43709 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BUD23O43709 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BUD23O43709 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms