Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF13O43567 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF13O43567 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF13O43567 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF13O43567 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF13O43567 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF13O43567 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF13O43567 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF13O43567 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF13O43567 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF13O43567 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF13O43567 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF13O43567 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF13O43567 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF13O43567 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF13O43567 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF13O43567 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF13O43567 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF13O43567 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF13O43567 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF13O43567 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF13O43567 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF13O43567 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF13O43567 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF13O43567 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF13O43567 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF13O43567 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF13O43567 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF13O43567 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF13O43567 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF13O43567 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF13O43567 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF13O43567 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF13O43567 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF13O43567 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF13O43567 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF13O43567 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF13O43567 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF13O43567 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF13O43567 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF13O43567 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF13O43567 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF13O43567 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF13O43567 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF13O43567 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF13O43567 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF13O43567 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF13O43567 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF13O43567 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF13O43567 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF13O43567 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF13O43567 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF13O43567 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF13O43567 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RNF13O43567 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RNF13O43567 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RNF13O43567 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RNF13O43567 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF13O43567 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF13O43567 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF13O43567 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF13O43567 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF13O43567 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF13O43567 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF13O43567 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF13O43567 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF13O43567 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF13O43567 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RNF13O43567 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF13O43567 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF13O43567 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF13O43567 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF13O43567 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF13O43567 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF13O43567 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RNF13O43567 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF13O43567 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF13O43567 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF13O43567 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF13O43567 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF13O43567 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF13O43567 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF13O43567 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF13O43567 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RNF13O43567 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF13O43567 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF13O43567 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF13O43567 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF13O43567 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RNF13O43567 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF13O43567 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF13O43567 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF13O43567 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF13O43567 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF13O43567 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF13O43567 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RNF13O43567 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF13O43567 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF13O43567 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RNF13O43567 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms