Protein–RNA interactions for Protein: O43414

ERI3, ERI1 exoribonuclease 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERI3O43414 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERI3O43414 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERI3O43414 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ERI3O43414 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERI3O43414 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ERI3O43414 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERI3O43414 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERI3O43414 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERI3O43414 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERI3O43414 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERI3O43414 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERI3O43414 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERI3O43414 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ERI3O43414 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERI3O43414 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERI3O43414 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERI3O43414 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERI3O43414 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERI3O43414 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERI3O43414 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERI3O43414 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERI3O43414 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERI3O43414 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERI3O43414 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERI3O43414 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERI3O43414 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERI3O43414 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERI3O43414 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERI3O43414 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERI3O43414 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERI3O43414 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERI3O43414 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERI3O43414 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERI3O43414 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERI3O43414 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERI3O43414 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERI3O43414 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERI3O43414 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERI3O43414 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERI3O43414 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERI3O43414 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERI3O43414 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERI3O43414 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERI3O43414 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERI3O43414 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERI3O43414 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERI3O43414 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERI3O43414 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ERI3O43414 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERI3O43414 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERI3O43414 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERI3O43414 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERI3O43414 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERI3O43414 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERI3O43414 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERI3O43414 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERI3O43414 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERI3O43414 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERI3O43414 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERI3O43414 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERI3O43414 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERI3O43414 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERI3O43414 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERI3O43414 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERI3O43414 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ERI3O43414 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ERI3O43414 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERI3O43414 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERI3O43414 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERI3O43414 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERI3O43414 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERI3O43414 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERI3O43414 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERI3O43414 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERI3O43414 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERI3O43414 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERI3O43414 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERI3O43414 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERI3O43414 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERI3O43414 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ERI3O43414 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERI3O43414 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERI3O43414 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERI3O43414 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERI3O43414 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERI3O43414 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERI3O43414 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERI3O43414 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERI3O43414 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERI3O43414 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERI3O43414 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERI3O43414 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERI3O43414 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERI3O43414 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERI3O43414 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ERI3O43414 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERI3O43414 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERI3O43414 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERI3O43414 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERI3O43414 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms