Protein–RNA interactions for Protein: O15318

POLR3G, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3GO15318 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR3GO15318 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR3GO15318 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR3GO15318 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR3GO15318 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3GO15318 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3GO15318 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3GO15318 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3GO15318 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3GO15318 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3GO15318 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3GO15318 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3GO15318 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3GO15318 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3GO15318 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3GO15318 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3GO15318 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3GO15318 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3GO15318 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3GO15318 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3GO15318 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3GO15318 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3GO15318 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3GO15318 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3GO15318 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3GO15318 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3GO15318 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3GO15318 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3GO15318 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3GO15318 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3GO15318 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3GO15318 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3GO15318 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3GO15318 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3GO15318 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR3GO15318 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR3GO15318 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR3GO15318 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR3GO15318 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR3GO15318 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR3GO15318 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR3GO15318 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3GO15318 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3GO15318 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3GO15318 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3GO15318 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3GO15318 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3GO15318 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR3GO15318 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR3GO15318 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR3GO15318 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR3GO15318 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR3GO15318 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR3GO15318 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR3GO15318 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR3GO15318 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR3GO15318 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR3GO15318 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR3GO15318 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR3GO15318 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR3GO15318 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR3GO15318 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR3GO15318 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3GO15318 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3GO15318 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3GO15318 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3GO15318 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3GO15318 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3GO15318 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3GO15318 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3GO15318 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3GO15318 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3GO15318 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3GO15318 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3GO15318 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3GO15318 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3GO15318 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3GO15318 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3GO15318 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3GO15318 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3GO15318 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3GO15318 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3GO15318 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3GO15318 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
POLR3GO15318 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3GO15318 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3GO15318 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3GO15318 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3GO15318 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3GO15318 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3GO15318 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3GO15318 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3GO15318 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3GO15318 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3GO15318 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3GO15318 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3GO15318 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3GO15318 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3GO15318 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3GO15318 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms