Protein–RNA interactions for Protein: O15232

MATN3, Matrilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN3O15232 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MATN3O15232 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MATN3O15232 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MATN3O15232 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MATN3O15232 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MATN3O15232 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MATN3O15232 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MATN3O15232 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MATN3O15232 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MATN3O15232 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MATN3O15232 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MATN3O15232 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MATN3O15232 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MATN3O15232 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MATN3O15232 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MATN3O15232 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MATN3O15232 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MATN3O15232 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MATN3O15232 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
MATN3O15232 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MATN3O15232 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MATN3O15232 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MATN3O15232 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MATN3O15232 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MATN3O15232 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MATN3O15232 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MATN3O15232 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MATN3O15232 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MATN3O15232 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MATN3O15232 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MATN3O15232 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MATN3O15232 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MATN3O15232 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MATN3O15232 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MATN3O15232 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MATN3O15232 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MATN3O15232 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MATN3O15232 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MATN3O15232 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MATN3O15232 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MATN3O15232 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MATN3O15232 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MATN3O15232 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MATN3O15232 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MATN3O15232 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MATN3O15232 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MATN3O15232 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MATN3O15232 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MATN3O15232 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MATN3O15232 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MATN3O15232 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MATN3O15232 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MATN3O15232 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MATN3O15232 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MATN3O15232 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MATN3O15232 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MATN3O15232 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MATN3O15232 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MATN3O15232 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MATN3O15232 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MATN3O15232 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MATN3O15232 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MATN3O15232 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MATN3O15232 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MATN3O15232 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MATN3O15232 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MATN3O15232 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MATN3O15232 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MATN3O15232 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MATN3O15232 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MATN3O15232 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MATN3O15232 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MATN3O15232 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MATN3O15232 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MATN3O15232 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MATN3O15232 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MATN3O15232 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MATN3O15232 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MATN3O15232 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MATN3O15232 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MATN3O15232 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MATN3O15232 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MATN3O15232 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MATN3O15232 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MATN3O15232 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MATN3O15232 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MATN3O15232 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MATN3O15232 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MATN3O15232 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MATN3O15232 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MATN3O15232 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MATN3O15232 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MATN3O15232 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MATN3O15232 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MATN3O15232 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MATN3O15232 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MATN3O15232 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MATN3O15232 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MATN3O15232 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MATN3O15232 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms