Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP290O15078 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP290O15078 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP290O15078 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP290O15078 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP290O15078 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP290O15078 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP290O15078 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CEP290O15078 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CEP290O15078 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CEP290O15078 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CEP290O15078 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP290O15078 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP290O15078 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP290O15078 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CEP290O15078 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CEP290O15078 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CEP290O15078 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CEP290O15078 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP290O15078 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP290O15078 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP290O15078 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP290O15078 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP290O15078 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP290O15078 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CEP290O15078 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CEP290O15078 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CEP290O15078 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CEP290O15078 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CEP290O15078 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CEP290O15078 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CEP290O15078 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CEP290O15078 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CEP290O15078 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CEP290O15078 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CEP290O15078 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CEP290O15078 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CEP290O15078 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CEP290O15078 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CEP290O15078 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CEP290O15078 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CEP290O15078 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CEP290O15078 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CEP290O15078 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CEP290O15078 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CEP290O15078 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CEP290O15078 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CEP290O15078 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP290O15078 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP290O15078 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP290O15078 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP290O15078 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP290O15078 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP290O15078 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP290O15078 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP290O15078 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP290O15078 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP290O15078 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP290O15078 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP290O15078 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP290O15078 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP290O15078 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP290O15078 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP290O15078 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP290O15078 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP290O15078 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP290O15078 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP290O15078 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CEP290O15078 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CEP290O15078 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CEP290O15078 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CEP290O15078 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CEP290O15078 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CEP290O15078 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CEP290O15078 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CEP290O15078 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CEP290O15078 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CEP290O15078 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CEP290O15078 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CEP290O15078 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CEP290O15078 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CEP290O15078 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CEP290O15078 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CEP290O15078 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CEP290O15078 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP290O15078 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP290O15078 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP290O15078 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP290O15078 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP290O15078 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP290O15078 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP290O15078 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP290O15078 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP290O15078 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP290O15078 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP290O15078 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP290O15078 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP290O15078 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP290O15078 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP290O15078 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
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