Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SYNMO15061 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SYNMO15061 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SYNMO15061 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SYNMO15061 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SYNMO15061 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SYNMO15061 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SYNMO15061 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SYNMO15061 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SYNMO15061 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SYNMO15061 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SYNMO15061 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SYNMO15061 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SYNMO15061 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SYNMO15061 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SYNMO15061 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SYNMO15061 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SYNMO15061 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
SYNMO15061 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SYNMO15061 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
SYNMO15061 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SYNMO15061 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SYNMO15061 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SYNMO15061 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SYNMO15061 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SYNMO15061 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
SYNMO15061 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SYNMO15061 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
SYNMO15061 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SYNMO15061 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SYNMO15061 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SYNMO15061 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
SYNMO15061 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SYNMO15061 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SYNMO15061 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SYNMO15061 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SYNMO15061 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SYNMO15061 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
SYNMO15061 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
SYNMO15061 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
SYNMO15061 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SYNMO15061 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SYNMO15061 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SYNMO15061 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
SYNMO15061 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SYNMO15061 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SYNMO15061 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SYNMO15061 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SYNMO15061 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SYNMO15061 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SYNMO15061 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SYNMO15061 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SYNMO15061 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SYNMO15061 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
SYNMO15061 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
SYNMO15061 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
SYNMO15061 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SYNMO15061 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
SYNMO15061 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SYNMO15061 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
SYNMO15061 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SYNMO15061 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SYNMO15061 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SYNMO15061 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SYNMO15061 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SYNMO15061 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SYNMO15061 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SYNMO15061 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SYNMO15061 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SYNMO15061 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SYNMO15061 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
SYNMO15061 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SYNMO15061 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SYNMO15061 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SYNMO15061 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SYNMO15061 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SYNMO15061 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SYNMO15061 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SYNMO15061 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
SYNMO15061 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
SYNMO15061 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
SYNMO15061 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
SYNMO15061 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
SYNMO15061 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SYNMO15061 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SYNMO15061 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SYNMO15061 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SYNMO15061 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SYNMO15061 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SYNMO15061 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SYNMO15061 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SYNMO15061 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SYNMO15061 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SYNMO15061 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SYNMO15061 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SYNMO15061 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SYNMO15061 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SYNMO15061 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SYNMO15061 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SYNMO15061 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms