Protein–RNA interactions for Protein: O14593

RFXANK, DNA-binding protein RFXANK, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXANKO14593 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RFXANKO14593 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFXANKO14593 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFXANKO14593 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFXANKO14593 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFXANKO14593 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFXANKO14593 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFXANKO14593 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFXANKO14593 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RFXANKO14593 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFXANKO14593 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFXANKO14593 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFXANKO14593 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFXANKO14593 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFXANKO14593 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFXANKO14593 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFXANKO14593 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFXANKO14593 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFXANKO14593 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFXANKO14593 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFXANKO14593 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFXANKO14593 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFXANKO14593 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFXANKO14593 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFXANKO14593 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFXANKO14593 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RFXANKO14593 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RFXANKO14593 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RFXANKO14593 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFXANKO14593 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFXANKO14593 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFXANKO14593 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFXANKO14593 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFXANKO14593 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFXANKO14593 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFXANKO14593 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFXANKO14593 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFXANKO14593 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFXANKO14593 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFXANKO14593 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFXANKO14593 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFXANKO14593 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFXANKO14593 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFXANKO14593 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFXANKO14593 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFXANKO14593 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFXANKO14593 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFXANKO14593 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFXANKO14593 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RFXANKO14593 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFXANKO14593 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFXANKO14593 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFXANKO14593 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RFXANKO14593 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFXANKO14593 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFXANKO14593 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFXANKO14593 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFXANKO14593 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFXANKO14593 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFXANKO14593 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFXANKO14593 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFXANKO14593 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFXANKO14593 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFXANKO14593 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFXANKO14593 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFXANKO14593 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RFXANKO14593 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFXANKO14593 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFXANKO14593 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms