Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHLHE40O14503 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHLHE40O14503 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHLHE40O14503 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHLHE40O14503 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHLHE40O14503 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHLHE40O14503 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHE40O14503 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHE40O14503 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHE40O14503 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHE40O14503 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHE40O14503 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHE40O14503 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHE40O14503 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHE40O14503 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHE40O14503 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHE40O14503 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHLHE40O14503 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHLHE40O14503 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHLHE40O14503 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHLHE40O14503 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHLHE40O14503 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHLHE40O14503 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHLHE40O14503 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHE40O14503 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHE40O14503 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHE40O14503 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHE40O14503 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHE40O14503 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHE40O14503 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHE40O14503 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHE40O14503 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHE40O14503 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHLHE40O14503 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
BHLHE40O14503 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHLHE40O14503 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHLHE40O14503 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHLHE40O14503 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHLHE40O14503 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHLHE40O14503 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHLHE40O14503 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHLHE40O14503 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHLHE40O14503 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHLHE40O14503 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 202.8 ms