Protein–RNA interactions for Protein: O00746

NME4, Nucleoside diphosphate kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4O00746 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME4O00746 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME4O00746 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME4O00746 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME4O00746 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME4O00746 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME4O00746 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME4O00746 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME4O00746 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME4O00746 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME4O00746 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME4O00746 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME4O00746 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME4O00746 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME4O00746 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME4O00746 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME4O00746 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME4O00746 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME4O00746 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME4O00746 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NME4O00746 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME4O00746 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME4O00746 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME4O00746 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME4O00746 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NME4O00746 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NME4O00746 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME4O00746 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME4O00746 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME4O00746 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME4O00746 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME4O00746 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME4O00746 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME4O00746 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME4O00746 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME4O00746 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME4O00746 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME4O00746 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME4O00746 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NME4O00746 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME4O00746 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME4O00746 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME4O00746 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME4O00746 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME4O00746 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME4O00746 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME4O00746 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME4O00746 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME4O00746 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME4O00746 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME4O00746 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME4O00746 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME4O00746 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME4O00746 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME4O00746 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME4O00746 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME4O00746 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME4O00746 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME4O00746 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME4O00746 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME4O00746 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME4O00746 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME4O00746 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME4O00746 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME4O00746 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NME4O00746 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NME4O00746 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NME4O00746 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NME4O00746 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NME4O00746 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NME4O00746 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NME4O00746 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NME4O00746 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NME4O00746 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME4O00746 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME4O00746 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME4O00746 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME4O00746 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME4O00746 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME4O00746 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME4O00746 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME4O00746 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME4O00746 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME4O00746 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME4O00746 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME4O00746 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NME4O00746 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME4O00746 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME4O00746 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME4O00746 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME4O00746 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME4O00746 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME4O00746 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME4O00746 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME4O00746 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME4O00746 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME4O00746 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME4O00746 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME4O00746 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME4O00746 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms