Protein–RNA interactions for Protein: O00626

CCL22, C-C motif chemokine 22, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL22O00626 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCL22O00626 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCL22O00626 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCL22O00626 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCL22O00626 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCL22O00626 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCL22O00626 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCL22O00626 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCL22O00626 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCL22O00626 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCL22O00626 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCL22O00626 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCL22O00626 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCL22O00626 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCL22O00626 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCL22O00626 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCL22O00626 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCL22O00626 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCL22O00626 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCL22O00626 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCL22O00626 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCL22O00626 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCL22O00626 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCL22O00626 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCL22O00626 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCL22O00626 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCL22O00626 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCL22O00626 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCL22O00626 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCL22O00626 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCL22O00626 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCL22O00626 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCL22O00626 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCL22O00626 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCL22O00626 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCL22O00626 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCL22O00626 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCL22O00626 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCL22O00626 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCL22O00626 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCL22O00626 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCL22O00626 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCL22O00626 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCL22O00626 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCL22O00626 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCL22O00626 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCL22O00626 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCL22O00626 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL22O00626 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL22O00626 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL22O00626 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL22O00626 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL22O00626 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL22O00626 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL22O00626 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL22O00626 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL22O00626 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL22O00626 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL22O00626 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL22O00626 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL22O00626 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL22O00626 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL22O00626 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL22O00626 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL22O00626 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL22O00626 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL22O00626 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL22O00626 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL22O00626 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCL22O00626 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCL22O00626 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCL22O00626 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCL22O00626 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCL22O00626 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCL22O00626 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCL22O00626 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCL22O00626 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCL22O00626 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCL22O00626 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCL22O00626 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCL22O00626 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCL22O00626 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCL22O00626 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCL22O00626 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCL22O00626 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCL22O00626 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCL22O00626 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCL22O00626 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCL22O00626 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCL22O00626 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCL22O00626 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCL22O00626 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCL22O00626 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCL22O00626 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCL22O00626 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCL22O00626 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCL22O00626 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCL22O00626 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCL22O00626 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCL22O00626 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms