Protein–RNA interactions for Protein: O00548

DLL1, Delta-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL1O00548 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DLL1O00548 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DLL1O00548 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DLL1O00548 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DLL1O00548 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DLL1O00548 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DLL1O00548 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DLL1O00548 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DLL1O00548 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DLL1O00548 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DLL1O00548 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DLL1O00548 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DLL1O00548 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DLL1O00548 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DLL1O00548 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DLL1O00548 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DLL1O00548 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DLL1O00548 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DLL1O00548 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DLL1O00548 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DLL1O00548 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DLL1O00548 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DLL1O00548 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DLL1O00548 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DLL1O00548 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DLL1O00548 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DLL1O00548 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DLL1O00548 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DLL1O00548 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DLL1O00548 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DLL1O00548 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DLL1O00548 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DLL1O00548 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DLL1O00548 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DLL1O00548 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DLL1O00548 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DLL1O00548 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DLL1O00548 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DLL1O00548 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DLL1O00548 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DLL1O00548 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DLL1O00548 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DLL1O00548 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DLL1O00548 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DLL1O00548 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DLL1O00548 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DLL1O00548 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DLL1O00548 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DLL1O00548 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DLL1O00548 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DLL1O00548 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DLL1O00548 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
DLL1O00548 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DLL1O00548 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DLL1O00548 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DLL1O00548 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DLL1O00548 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DLL1O00548 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DLL1O00548 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DLL1O00548 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DLL1O00548 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DLL1O00548 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DLL1O00548 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DLL1O00548 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DLL1O00548 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DLL1O00548 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DLL1O00548 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DLL1O00548 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DLL1O00548 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DLL1O00548 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DLL1O00548 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DLL1O00548 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DLL1O00548 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DLL1O00548 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
DLL1O00548 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DLL1O00548 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DLL1O00548 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DLL1O00548 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DLL1O00548 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DLL1O00548 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
DLL1O00548 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DLL1O00548 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DLL1O00548 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DLL1O00548 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
DLL1O00548 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
DLL1O00548 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DLL1O00548 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DLL1O00548 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DLL1O00548 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DLL1O00548 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DLL1O00548 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DLL1O00548 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DLL1O00548 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DLL1O00548 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DLL1O00548 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DLL1O00548 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DLL1O00548 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DLL1O00548 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DLL1O00548 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DLL1O00548 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms