Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AGRNO00468 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AGRNO00468 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AGRNO00468 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AGRNO00468 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AGRNO00468 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AGRNO00468 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AGRNO00468 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AGRNO00468 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AGRNO00468 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AGRNO00468 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AGRNO00468 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AGRNO00468 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AGRNO00468 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AGRNO00468 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AGRNO00468 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AGRNO00468 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AGRNO00468 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AGRNO00468 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AGRNO00468 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AGRNO00468 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AGRNO00468 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AGRNO00468 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AGRNO00468 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AGRNO00468 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AGRNO00468 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AGRNO00468 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AGRNO00468 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AGRNO00468 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AGRNO00468 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AGRNO00468 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AGRNO00468 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AGRNO00468 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AGRNO00468 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
AGRNO00468 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AGRNO00468 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AGRNO00468 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AGRNO00468 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AGRNO00468 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AGRNO00468 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AGRNO00468 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
AGRNO00468 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AGRNO00468 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AGRNO00468 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AGRNO00468 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AGRNO00468 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AGRNO00468 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AGRNO00468 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AGRNO00468 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AGRNO00468 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
AGRNO00468 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AGRNO00468 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AGRNO00468 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AGRNO00468 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AGRNO00468 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
AGRNO00468 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AGRNO00468 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
AGRNO00468 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AGRNO00468 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AGRNO00468 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AGRNO00468 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AGRNO00468 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AGRNO00468 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AGRNO00468 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AGRNO00468 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AGRNO00468 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AGRNO00468 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AGRNO00468 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AGRNO00468 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AGRNO00468 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AGRNO00468 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AGRNO00468 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AGRNO00468 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
AGRNO00468 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AGRNO00468 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AGRNO00468 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGRNO00468 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGRNO00468 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGRNO00468 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGRNO00468 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGRNO00468 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
AGRNO00468 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGRNO00468 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGRNO00468 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGRNO00468 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGRNO00468 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGRNO00468 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGRNO00468 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGRNO00468 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGRNO00468 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGRNO00468 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGRNO00468 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGRNO00468 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGRNO00468 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGRNO00468 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGRNO00468 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGRNO00468 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGRNO00468 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGRNO00468 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGRNO00468 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms